Фекальная трансплантация включает в себя пересадку стула от здорового человека и больному. Этот шокирующий для некоторых людей метод терапии может быть единственный шанс вылечить пациента, а иногда и спасти его жизнь, так как он эффективен тогда, когда антибиотики уже не работают. Что такое фекальная трансплантация и каковы показания для ее применения?

Пересадку стула включает в себя трансплантацию образца кала здорового человека в кишечник больного пациента. Стул содержит полезные образцы бактериальной флоры, которая во многих случаях может помочь вылечить пациента, а иногда и спасти его жизнь. Этот шокирующий метод лечения используется для лечения чаще всего тяжелых , в том числе Clostridium difficile- этиологии. Многочисленные исследования уже показали, что трансплантация фекальной микробиоты (Fecal Microbiota Transplantation, FMT) эффективна в лечении и предупреждении рецидивов кишечных инфекций, вызываемых бактериями Clostridium difficile, например, псевдомембранозного энтероколита.

Фекальная трансплантация: показания

Трансплантация фекалий используются для восстановления природной бактериальной флоры. Таким образом, этот вид лечения может быть использован после тяжелого лечения антибиотиками, что привело к исчезновению «хороших» кишечных бактерий и в дальнейшем к развитию устойчивых к антибиотикам инфекций толстой кишки, например Clostridium difficile , которая является одним из основных возбудителей псевдомембранозного колита.

Эта процедура также может быть выполнена у пациентов, подвергающихся химиотерапии.

Фекальная трансплантация рассматривается как экспериментальный метод лечения таких заболеваний как ожирение и метаболический синдром, рассеянный склероз, болезнь Паркинсона, синдром хронической усталости и аутизм. На данный момент эти методы проходят исследования.

Пересадка стула: кто может быть донором?

Фекальная трансплантация: что это? Каким образом выполняется процедура?

До пересадки кишечник реципиента очищается от каловых масс при помощи клизм. Затем образец фекального препарата (20-30 мл) вводят в толстую кишку реципиента с помощью эндоскопа во время колоноскопии, или вводят зондом непосредственно в двенадцатиперстную кишку. В Канаде фекальные препараты доступны в форме капсул, которые принимают per os, растворяющихся в двенадцатиперстной кишке. Такие процедуры проводятся по всему миру.

В США в течение последних лет широко применяется и стремительными темпами набирает популярность пересадка нормальной кишечной флоры от здорового донора реципиенту, страдающему расстройствами стула. Накопленный в Северной Америке большой положительный клинический опыт, рекомендации Национального Института Здоровья США (NIH, USA) дали основания для применения этого инновационного способа лечения по всему миру.

Не проводите фекальные трансплантации у себя дома!

Не выполняйте фекальную трансплантацию на дому с использованием клизм! Донором может быть только здоровый человек. Состояние кала для пересадки обязательно должно быть лабораторно исследовано. Существует очень большой риск заражения инфекционными заболеваниями при нарушении техники выполнения манипуляции, например, вирусными гепатитами.

Американские учёные разработали инновационный метод лечения стойких к обычным антибиотикам кишечных инфекций путём фекальной трансплантации микроорганизмов.

Желудочно-кишечный тракт человеческого организма содержит тысячи полезных, необходимых для поддержания здоровья бактерий. Используемые при лечении многих болезней антибиотики разрушают внутри кишечника благотворную для «хороших» бактерий среду обитания. В поврежденной микрофлоре начинают процветать болезнетворные микроорганизмы. Одной из вредных для человека бактерий является Clostridium difficile. Она вызывает у людей инфекционный колит в тяжелой форме, сопровождающийся стойкой диареей, тошнотой и рвотой.

Как правило, для лечения псевдомембранозного колита применяются препараты ванкомицин и метронидазол, относящиеся к группе антибиотиков. Штаммы Clostridium difficile крайне слабо поддаются подобному лечению, поскольку являются весьма антибиотикоустойчивыми.

Из-за невозможности вылечить энтероколит консервативными методами врачам приходится идти на оперативное вмешательство и удалять пациентам участок кишечника, затронутый болезнью!

По данным медицинской статистики Соединенных Штатов Америки в 2012 году диагноз инфицирования бактерией Clostridium difficile был поставлен 347 тысячам человек. Из них умерли от данного заболевания почти 30 000 пациентов.

Фекальные трансплантации под названием «жёлтый суп» делались специалистами китайской народной медицины ещё в 4-ом веке. В разных регионах мира издавна применяют подобную практику для укрепления иммунной системы новорожденных. С этой целью в толстую кишку ребенка помещается небольшое количество кала его матери. Попавшие в ЖКТ малыша полезные микробы тотчас начинают там расселяться, создавая надежный защитный барьер для инфекции.

Американские учёные работают над проблемой фекальной трансплантации с 50-ых годов прошлого столетия. Множество экспериментов за эти годы было поставлено ими на животных. Наконец, в 2012 году, настал момент, когда в экспериментально проводимом медиками лечении калом приняли участие сорок девять человек.

Исследование происходило на базе клиники имени Генри Форда. Все пациенты страдали от тяжелой формы энтероколита, сопровождавшейся хронической диареей. Американскими специалистами было установлено, что болезнь вызвана именно бактерией C.difficile.

Всем пациентам-участникам проекта с помощью эндоскопа или во время процедуры колоноскопии была проведена трансплантация фекальной микробиоты. Кал был взят у здоровых людей, выступивших донорами. В толстую кишку каждого больного доктора вводили тёплую воду с растворенными в ней фекалиями в количестве 30-50 грамм.

У 90 процентов человек, прошедших данную процедуру, уже через пару часов после неё было зафиксировано явное улучшение самочувствия — у них появился аппетит. Спустя семь дней врачи констатировали полное выздоровление этой группы пациентов. После проведения пересадки кала доктора наблюдали за участниками эксперимента ещё в течение трёх месяцев и отметили отсутствие у них каких-либо побочных эффектов или осложнений примененного метода.

Вслед за американцами практическими исследованиями в области трансплантации кала занялись специалисты Амстердамского Университета. Вначале они привлекли к эксперименту 120 добровольцев. Затем, оценив состояние здоровья каждого пациента, оставили для проведения нескольких процедур пересадки кала только шестнадцать человек. Тринадцать из участников эксперимента стали полностью здоровы после первой же процедуры. Вторая процедура вернула здоровье еще двоим.

Параллельно с этим испытанием 26 пациентов с аналогичным заболеванием получали лечение ванкомицином. Выздоровели только семеро из них. Остальные, не имея в лечении положительной динамики, обратились к врачам с просьбой включить их в число лиц, которым делалась пересадка фекальных бактерий. Доктора пошли больным навстречу и сделали им пересадку кала. Некоторые из этих пациентов выздоровели уже после одной процедуры, другие — после двух.

Положительный опыт амстердамских коллег побудил медиков США создать в текущем году банк фекальных образцов, предназначенный для излечения людей, страдающих тяжелой формой рецидивирующей диареи!

Ученые Австралии в ходе экспериментальной терапии установили связь между применением фекальных донорских бактерий и одновременным уменьшением у пациентов запоров и симптомов болезни Паркинсона. Исследователи предполагают, что при повреждении микрофлоры в кровь из неё проникают некоторые антигены. На таком фоне у человека быстро развивается паркинсонизм. Также это способствует развитию ряда аутоиммунных заболеваний, ревматоидного артрита, синдрома хронической усталости, рассеянного склероза.

Существует гипотеза, что пересадка кала способствует снижению веса и может рассматриваться как один из эффективных способов похудания!

Изначально трансплантация фекалий осуществлялась через клизму, колоноскоп или питательный зонд. Но такие способы доставки в организм больного здоровой микрофлоры малокомфортны и могут повлечь за собой травмирование желудочно-кишечного тракта.

В связи с этим учёные Америки разработали новый метод пересадки фекальной микробиоты – через рот. Для этого ими были созданы специальные капсулы для перорального приёма. В них разработчики метода поместили натуральный замороженный донорский кал, имеющий в составе жизнетворные бактерии и свободный от любых аллергенов.

Сами капсулы делались из вещества, устойчивого к кислотной желудочной среде.

В первом исследовательском опыте участвовали двадцать пациентов разной возрастной категории. В составе группы испытуемых были дети в возрасте 11 лет, были и больные, которым за восемьдесят. Каждый участник пилотного исследования выпивал ежедневно по 15 фекальных капсул.

После двухдневного приема нового лекарства у 14 человек полностью исчезли все симптомы заболевания. Повторение курса фекалотерапии для остальных шести участников группы принесло положительные результаты. Интересно, что состояние здоровья этих шести человек было значительно хуже, чем у остальных.

Отрицательных побочных явлений при проведении терапевтического эксперимента не выявлено.

Американские специалисты, окрыленные первым успехом, нацелены теперь на более полновесное и крупномасштабное исследование, целью которого они видят для себя подтверждение первоначальных выводов о действенности и безопасности нового, перорального способа пересадки кала.

19.03.2014

Новосибирские медики начали лечить болезни с помощью фекалий - для их производства требуются молодые доноры

Эта новость кажется настолько абсурдной, что в нее не сразу веришь. Новосибирские ученые утверждают, что некоторые заболевания можно излечить с помощью пересадки в организм заболевшего донорского кала. Зарабатывание денег на обычном дерьме, это - уже что-то из Пелевина. Правда, современная история все чаще показывает, что поп-метафизика этого российского писателя абсурда все чаще оказывается нашей реальностью. Так и здесь. О калотерапии корреспондент НГС.НОВОСТИ подробно поговорил с академиком РАН Валентином Власовым, директором Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, где и проводятся такие исследования.

Новость эта кажется настолько абсурдной с точки зрения обывателя, что первым делом хочется переспросить: это правда? Как новосибирские ученые дошли до такого?

Это действительно правда. Но новосибирские ученые тут идут по следам западных коллег. Процедура пересадки кала использовалась еще 1500 лет назад в Китае. Но тогда это было на уровне знахарства. А лет семь назад этим делом занялись австралийские ученые. Какое-то время назад расшифровали геном человека, а затем стали изучать бактерии, которые человека населяют. Большое количество бактерий, живущих у нас в кишечнике, защищают нас от вредных микроорганизмов, которые попадают с пищей, эти бактерии помогают переваривать пищу, синтезируют витамины, необходимые для нашего здоровья. То есть внутри нас трудится огромная машина - таких бактерий там триллионы.

И вот австралийцы пытались найти связь между способами питания, микрофлорой и т.д. А мы внимательно наблюдали за развитием событий за рубежом: например, в США эта процедура уже года два применяется. Споры только идут на уровне - нужно это как-то регулировать или нет? На сегодня считается, что это можно делать без особых испытаний. Мы давно собирались, но все не могли осмелиться, поскольку тема как-то уж звучит очень необычно.

Как давно у нас начались исследования? Первую, скажем так, операцию по пересадке кала когда сделали?

Мы только что начали - проработали протокол, разработали методику… А думали и обсуждали это все года три уже… Пациентов пока еще мало - несколько человек. Но пересадку мы уже провели. Результаты конкретно по этим исследованиям будут позже.

От чего излечивает эта процедура?

Процедура прекрасно излечивает от хронического поноса. То есть такой, который никакой антибиотик не берет. По России у меня нет цифр, но по США они публиковали - каждый год от такого поноса умирает около 15 тыс. человек, вылечить которых не могут. Антибиотики не помогают, а эта процедура помогает быстро.

Такие хронические поносы вызывает бактерия Clostridium dificile. У человека с нормальной микрофлорой микрофлора ее побеждает, а у кого чего-то не хватает - либо какого-то микроба, либо бактериофага (это вирусы, которые побеждают вредные бактерии), - тому и нужна такая пересадка.

А насколько данная процедура дорогая?

Трудно сказать. У нас еще пока идет экспериментальное исследование. А в США есть специальная фирма, которая продает фекалии по 250 долларов за пакетик. И даже не одна такая фирма.

Как проходит калопересаживание?

Зонд вводится либо через задний проход, либо глубоко в рот - в верхний отдел кишечника. Через задний проход - технологически труднее, но безопаснее. Были попытки сделать и таблетки в оболочке.

Конечно, были идеи не брать фекалии, а выделить чистые бактерии и давать только их. Но это, во-первых, увеличит цену, так как будет считаться лекарством и должно пройти все проверки, но самое главное - что все бактерии, которых великое множество, не всегда удается культивировать. Некоторые бактерии не растут вне нашего организма, они так и называются - некультивируемые.

Откуда берется донорский материал и как он хранится - есть ли срок годности у этого, простите, дерьма?

Его можно заморозить быстрой заморозкой…

Кто может стать донором? Почему чаще это родные?

Здесь начинали с того, что брали у родственников - у них сходная микрофлора. Но сейчас эти специальные фирмы привлекают доноров - молодых, здоровых людей, обследуют их, потом берут материал и замораживают.

Проводили исследования среди городских жителей и людей из сельских регионов. У первых набор микроорганизмов менее богатый, чем у вторых. Мы аналогичные исследования ведем - сравниваем состав микрофлоры здоровых людей и тех, у кого есть опухолевые заболевания желудка и кишечника.

Как вы думаете, это явление - калопересадка - будет таким же упорядоченным, как и сдача крови: приемные пункты, оплата донорского материала?

Мне кажется, что официальные исследования и тестирование все же могли бы повысить уровень доверия к такому необычному способу лечения…

Я отвечу просто: у нас есть технологии, связанные со стволовыми клетками. Наша замечательная Дума уже лет пять не может издать закон по клеточным технологиям - они даже не могут определиться, что такое клеточные технологии и клетки? А здесь же даже вопрос не поднимался. И кто его будет поднимать? Ведь методика - очевидно, что безобидная. Да и за рубежом она уже подробно описана. В нашем случае (в институте. - И.К. ) есть квалифицированные специалисты, есть этический комитет, который дает разрешение на эксперимент, а далее мы берем американские стандарты, изучаем их и идем по этому пути.

Критики скажут, что здесь просто делаются деньги на дерьме - пусть не по 250 долларов, но деньги-то брать будут все равно…

Деньги брать будут. Донора надо обследовать. А всесторонне обследовать человека - не очень то и дешево. Мы вот обследовали, это где-то выходило в 20–25 тыс. руб. Плюс еще сама процедура - эндоскопическое введение чего-то стоит. Но о цене пока рано говорить. Сейчас мы нарабатываем базу - будем проводить испытания и на животных, чтобы понять воздействие этого метода на разные заболевания.

В каких странах такое уже активно применяют и с какой эффективностью?

Публикации идут из США. У них это широко применяется. Эффективность излечивания от поносов очень высокая. Поэтому и говорилось: мол, аморально устраивать какие-то еще дополнительные проверки, когда умирают люди. Простой клизмой спасти 10 тыс. человек - нормально или нет? Тут разговор ни о чем.

Почему у нас не применяли этот способ, раз о нем было известно и ранее?

Это инертность и слабость нашей медицины. Медицинская микробиология у нас вообще на очень слабом уровне… У космонавтов проводили исследования - об изменении микробов в кишечнике. Это был российский эксперимент, и мы тут оказались впереди всех, но это - космическая область. А в принципе - мы в данном направлении сильно отстаем.

Почему нельзя заменить кал теми же пребиотиками, которые применяются давно?

Пребиотики на самом деле не обладают теми свойствами, которые им приписываются. Вы съели продукт, полезные микробы попали в желудок, а там их убили наши микробы почти мгновенно.

Сами эти продукты - всякие «даноны» и др., - конечно, полезны сами по себе. Но микробы, которые с такими продуктами попадают к нам в организм, не приживаются. Это один из интересных результатов, который обнаружен в последнее время. Тут, конечно, самый лучший, на мой взгляд, кольцовский продукт - там живые бактерии. Они, конечно, влияют на микрофлору, но не замещают ее. А во многих других продуктах - сплошные консерванты, и там вообще все «дохлое».

Вы допускаете, что и другие болезни можно вылечить таким же способом - калопересадкой? Можно предположить - какие?

Есть уверенность, что очень многие заболевания можно так лечить, понос - лишь самое простое. Нарушение метаболизма, которое приводит к заболеваниям, совершенно очевидно связано с микрофлорой, его наверняка удастся корректировать. Это - начало большого пути. Ведутся разговоры, что нарушения мозговой деятельности можно корректировать таким образом. Детский аутизм, например. Но это только соображения - доказательств нет.

Проводили эксперимент на мышах по нарушениям, связанным с их весом. Бактерии, которые жили в тучных людях, делали мышей толстыми и - наоборот. Сейчас этим как раз и занимаются, но результатов испытаний на людях пока еще нет.

Какими еще нетрадиционными способами можно вылечить человека?

Множество их… Если говорить о лечении, то большая перспектива у бактериофагов. Лечение инфекционных заболеваний бактериофагами разрабатывалось еще в Советском Союзе. Большой центр был создан по инициативе Сталина. Проводились испытания против поноса, против гнойных заболеваний, т.е. там, где участвовали бактерии. Проводились в Советской армии. Но потом эта тема угасла, так как появились антибиотики. Сейчас же к этой теме вернулись, потому что развелось много бактерий, которые устойчивы к антибиотикам.

Но развитие этого направления идет пока не сильно быстро - нет пройденных испытаний, да и производить их (бактериофаги. - И.К. ) пока не выгодно. Во-первых, можно говорить о заговоре тех, кто производит антибиотики, а во-вторых, защитить патентом это очень трудно. То есть их легко украсть - если какая-то фирма начнет продавать такую штуку, любой может ее купить, размножить и устроить свое производство. Они же живые - и размножаются. Но интерес, повторю, к этому возрождается. И результаты исследований очень неплохие.

Илья Калинин
Фото thinkstockphotos.com (1), предоставлено Центром общественных связей СО РАН

Случаи безуспешных попыток восстановления нормальной бактериальной флоры кишечника после использования антибиотиков, на фоне течения заболеваний желудочно-кишечного тракта, становятся все более многочисленными и проблемы нарушений стула (запор или диарея) становятся болезнью цивилизации. В США в течение последних лет широко применяется и стремительными темпами набирает популярность пересадка нормальной кишечной флоры от здорового донора реципиенту, страдающему расстройствами стула. Накопленный в Северной Америке большой положительный клинический опыт, рекомендации Национального Института Здоровья США (NIH, USA) дали основания для применения этого инновационного способа лечения в России.

В 2012 году исследователи из больницы имени Генри Форда провели исследование с участием 49 пациентов, страдавших от тяжелой рецидивирующей диареи, вызванной Clostridium difficile. Для проведения процедуры был использован эндоскоп, через который в толстую кишку пациентов вводился гомогенизированный и отфильтрованный раствор, в состав которого входила теплая вода и от 30 до 50 граммов фекалий, взятых от здоровоых доноров. В некоторых случаях раствор вводился во время процедуры колоноскопии.

В результате у 90 % пациентов уже через два часа после процедуры появился аппетит, в течение суток они почувствовали значительное улучшение состояния, а через неделю они чувствовали себя полностью здоровыми. При этом в течение трех месяцев после терапии у них не развилось никаких осложнений или побочных эффектов такого метода лечения.

Другое исследование, проведенное в 2013 году учеными из Амстердамского университета, показало, что трансплантация кала в желудочно–кишечный тракт оказалась в три–четыре раза эффективнее антибиотиков. Первоначально исследователи планировали рекрутировать для участия в испытаниях 120 пациентов, но в итоге приняли решение остановить испытания ввиду очевидной разницы в состоянии здоровья обеих групп волонтеров. Из 16 членов группы, получавшей пересадку кала, 13 полностью выздоровели после первой же процедуры, еще двое - после второй (94 %), в то время, как из 26 пациентов, получавших ванкомицин, поправились только семеро (27 %). Остальные члены этой группы сами попросили врачей провести им такую же процедуру и выздоровели после одной–двух инфузий.

Также в феврале 2014 года в США появился первый в мире банк фекальных образцов для лечения пациентов, страдающих от тяжелой формы рецидивирующей диареи, вызванной антибиотикоустойчивым штаммом бактерии Clostridium difficile.

Помимо лечения кишечных инфекций, пересадка фекальных бактерий от доноров способна помочь снизить лишний вес. Исследователи надеются в ходе дальнейших экспериментов определить механизм влияния бактерий на процесс похудения и, возможно, предложить новый, безоперационный способ снижения веса.

Несколько лет назад австралийские ученые предложили лечить пациентов, страдающих одновременно болезнью Паркинсона и запорами, с помощью пересадки кала. Как показали результаты исследования, благодаря экспериментальной терапии у пациентов уменьшилась выраженность симптомов основного заболевания, в том числе паркинсонизма, рассеянного склероза, ревматоидного артрита и синдрома хронической усталости.

Согласно гипотезе ученых, при нарушении состава микрофлоры в кровоток попадают различные антигены. Они вызывают избыточную реакцию иммунитета, что оказывает влияние на развитие паркинсонизма и аутоиммунных заболеваний. Эти предположения подтверждают и другие исследования. В частности, по данным голландских специалистов, пересадка кала повышает чувствительность к инсулину у больных с метаболическим синдромом.

В России первые пересадки культур нормальной кишечной микрофлоры успешно прошли в г. Новосибирске в ЦНМТ в Академгородке. Такая пересадка по сути - заселение кишечника пациента с симптомами диареи/запора нормальной кишечной микрофлорой, полученной от здорового донора. При этом донор проходит тщательное обследование, необходимое для предотвращения передачи инфекционных заболеваний и полной уверенности в наличии нормальной здоровой микрофлоры. При обследовании используются стандарты Национального Института Здоровья США (NIH, USA).

Показания к пересадке микрофлоры

Трансплантации проводятся при хронических воспалительных заболеваниях кишечника (болезнь Крона , язвенный колит), синдроме раздражённого кишечника (как с запорами, так и с диареей), ожирении, в рамках лечения инфекций C. Difficile (псевдомембранозный энтероколит).

Процедура пересадки микрофлоры

Фактически - это перенос фекальных масс донора, растворенных в воде и содержащих полезные бактерии, реципиенту. Для того, чтобы микрофлора «прижилась», культуры бактерий помещаются именно в то место, где они и должны «жить и работать» - в толстый кишечник, - с помощью фиброколоноскопа – гибкого тонкого эндовидеоскопического инструмента. Эта процедура (колоноскопия) проходит под общим обезболиванием (седацией) после консультации гастроэнтеролога, прохождения обследования по индивидуальному плану и занимает 1 день. В последствие пациент получает подробные необременительные рекомендации и наблюдается у гастроэнтеролога в течение 2 недель. Согласно данным исследований на животных, пересадка фекальных бактерий способна восстановить нормальную микрофлору кишечника на 90 %.

Побочные эффекты процедуры

Не смотря на растущую популярность, опытной информации, в частности, в России, накоплено мало. Есть данные о том, что если пересадка осуществлена от пациента с ожирением, то реципиенту тоже грозит ожирение! Есть основание полагать, что тот же механизм применим и к другим заболеваниям.

Научный прогресс: фекалии в капсулах

Существующие методы трансплантации фекальной микробиоты – пересадка фекалий, взятых от здоровых доноров, через колоноскоп, назогастральный зонд или клизму – имеют потенциальный риск повреждения желудочно-кишечного тракта и несут пациентам определенный дискомфорт.

Поэтому американские ученые предложили пероральный способ трансплантации кала (через рот) при лечении кишечных инфекций. Результаты исследования показали, что прием замороженных фекалий в капсулах столь же эффективен и безопасен в борьбе с вызываемой бактерией Clostridium difficile диареей, как и инфузии фекалий через колоноскоп или назогастральный зонд.

Новый подход заключается в следующем: фекалии здоровых доноров замораживают, затем полученную из них смесь кишечных бактерий и фасуют в кислотоустойчивые капсулы, предназначенные для перорального приема. Предварительно проводится лабораторный анализ образцов фекалий на различные инфекции и аллергены.

В пилотном исследовании приняли участие 20 человек в возрасте от 11 до 84 лет с кишечной инфекцией, вызванной C. difficile. В течение двух дней каждый испытуемый принимал по 15 капсул с фекальным содержимым. У 14 человек экспериментальная терапия привела к полному исчезновению симптомов заболевания после единичного двухдневного курса. Остальным шести участникам исследования провели повторный курс лечения, после которого состояние пациентов также нормализовалось. В ходе испытания никаких побочных эффектов препарата отмечено не было.

Как отмечают авторы исследования, у пациентов, которым понадобился повторный курс терапии, исходное состояние здоровья было хуже, чем у остальных больных. «Полученные предварительные данные указывают на безопасность и эффективность нового подхода», – отметили исследователи. – Теперь мы можем провести более крупные и масштабные исследования для подтверждения этих данных и выявления наиболее эффективно действующих бактериальных смесей для перорального введения».

Доступность, безопасность и эффективность такого способа восстановления нормальной микрофлоры дают новые возможности для преодоления серьёзных проблем при хронических заболеваниях желудочно-кишечного тракта и расстройствах обмена веществ.

Как меняет твою жизнь, оптику и чувство нормы работа в лаборатории, где уже много лет изучают бактерии и вирусы, обитающие исключительно в испражнениях? Что такое «микробная тёмная материя», как она связана с облысением и медвежьей слюной - и другие детали неожиданного ландшафта, через который пролегает передовая микробиологического знания. Самиздат публикует анонимный рассказ специалиста по биоинформатике из одного российского НИИ.

Говорят, когда-то в нашей лаборатории был заведующий. Он всех принуждал к ведению ежедневного блога, запрещал микроволновки и медитировал в специально отведённой для этого комнате. Я его никогда не видела. Когда пришла, всё уже так и было: заведующий становился мифом, а лаборатория постепенно впадала в анархо-коммунистическое блаженство.

Коллегам из других лабораторий и институтов часто бывает сложно поверить, что нам удаётся жить и выживать без заведующего, поэтому мы придумали воображаемого заведующего и расклеиваем по этажу приказы от его имени за подписью «зав. лабораторией биоинформатики к.б.н. А. П. Жиром».

Функцию неформальных лидеров выполняют Саня, Саня и Саня. Поскольку в лаборатории работают ещё двое Сань, было решено, что вот были митьки, а мы все будем саньки. Саньки-биоинформатики из Института *****.

В остальном НИИ нас считают немного панками. Раньше мы ходили курить трубку во внутренний дворик института. Неподалёку была помойка, куда из института выкидывали всякие лабораторные ништяки: огромные деревянные ящики из-под секвенатора, доисторические приборы, цветные стёклышки и провода, советскую посуду. Мы с энтузиазмом в этом копались и поднимали самые интересные артефакты к себе на пятый этаж. Это всё прекрасно было видно из окон других лабораторий. Кажется, последними мы приволокли кленовые пни, оставленные рабочими во дворике. Было тяжело, но теперь нам есть на чём сидеть.

Темноватая магия

Это не единственный - подчёркиваю: далеко не единственный! - аспект нашей деятельности, но мы действительно пересаживаем кал. Вообще его в нашем НИИ изучают во всех проявлениях: размазывают, замораживают и секвенируют. А также пересаживают от человека к человеку.

Делается это либо:
а) гастроскопом в жидком виде через рот;
б) колоноскопом с другой стороны;
в) более приятно, но менее эффективно - в кристаллическом виде в капсулах. Запаха совсем нет, и с виду похоже на карамель.

Процедура эта используется для лечения тяжёлых кишечных болезней, и мы не сами её придумали. Эффект настолько волшебный, что за границей её начинают использовать как панацею от всего. Видела статьи, как более-менее успешно таким образом лечили аутизм и облысение - и бог знает что ещё, наверное, пытались.

Как бы это ни прозвучало, между аутизмом и бактериями в кишечнике действительно есть связь, хоть и не до конца понимаемая пока. Да и облысение имеется в виду не простое, а аутоиммунное: это когда лимфоциты решают, что волосяные луковицы - вредные посторонние объекты, которые подлежат уничтожению. Бактерии из чужого тела, видимо, вправляют мозги слегка поехавшей иммунной системе, напоминая, где свои, а где чужие.

Это всё работает как магия, потому что никто на свете не может доподлинно разобраться, как и за счёт чего. Собственно, наша задача в том и состоит, чтобы эту загадку разрешить, иначе врачи справились бы и без нас. Мы секвенируем и смотрим, какие микробы были в кишечнике до, а какие появились после пересадки кала; какие пришли от донора, а какие появились, казалось бы, из ниоткуда. И нам до сих пор ни черта не понятно.

Неизвестная бактерия № 6538

Дело в том, что в микробиологии есть своя так называемая микробная тёмная материя. Это бактерии и вирусы, которых никто никогда не видел, но которые реально живут и у человека в жопе, и у кошки, и под камнем в пустыне, и в кислотных шахтах, и в океане, и чего-то там все они делают. Но что именно - непонятно, потому что они по разным причинам не поддаются культивации в лабораторных условиях. Это не вполне очевидно, но далеко не все бактерии могут выжить и размножиться в чашке Петри, а значит, привычным методом изучать и описывать их почти невозможно.

Пока учёные совсем недавно не додумались просто тыкать пипеткой куда попало и секвенировать всё подряд, о масштабе этой проблемы даже и не было известно как следует. Это особенно верно в случае вирусов, так как бактерий более или менее описали, пусть и в стиле «неизвестная бактерия номер 6538, которую мы нашли в муравейнике». А в случае с вирусами мы дай бог если с пятью процентами знакомы. И вот единственное, что мы видим, - это как от донора к пациенту иногда переходит какая-то Неизвестная Штука и остаётся там. Что именно это за бактерии или вирусы, мы не знаем.

Давняя тема работы нашей лаборатории - выяснять, связано ли нечто (например, какая-то болезнь) с составом бактерий в кишечнике. Иные зарубежные коллеги уже без стеснений связали их с настроением и темпераментом , но и у нас не сдаются и ищут новые закономерности.

Помимо кишечной микрофлоры, я изучаю микрофлору вагинальную. И у нас как-то сами собой зарождались шутки о том, что её тоже пора пересаживать - для профилактики и общего оздоровления. Не так давно я случайно увидела такую работу: люди пересаживали микробиоту влагалища от морских свинок к морским свинкам и сообщали о замечательном эффекте и перспективности перенесения этого опыта и на человека.

На днях мне пришла в голову идея посмотреть, как изменяются бактерии при разложении трупа. Мысль эта привела в крайнее воодушевление: я озвучивала её на кухне, стоя на том самом пне, что мы притащили с помойки, и размахивала руками. Вечером того же дня выяснилось, что это уже сделали, но совсем недавно, и опубликовали про результаты эксперимента статью в Science .

Ликующая микробиота

Я донор. Даже значусь как «донор номер один». Не знаю, по порядку или по важности, но лестно. Потому как я охренительно здоровый человек, и материал мой якобы ценнейший и уже спас с десяток пациентов. Своеобразные ощущения принёс опыт одновременного «донорства» с мальчиком: находиться фактически в одной комнате и получать комплименты медсестёр и - о ужас! - ассистирующих коллег по поводу качества «материала». Сначала хотелось провалиться сквозь землю, но потом ничего, привыкла.

В этом году я, однако, занялась вегетарианством на грани сыроедения - отчасти для поиска новых ощущений в воздержании, отчасти из экспериментаторского азарта: как же изменятся мои бактерии? Стану ли я лучшим донором? Сверхдонором? Может быть, я заполучу сверхмикробиоту? Когда пришли анализы, меня вкрадчиво спросили, что случилось в моей жизни, потому что к донорству я была более не годна. Пообещав больше так не делать, я перешла на обычную диету, но тщетно: материал по-прежнему содержит условно-патогенные бактерии. Мой случай обсуждали недавно на конференции - на заседании по пересадке кала. Другие исследователи делились опытом: у них с вегетарианцами тоже выходило не очень, поэтому постановили их в доноры больше не брать.